Gljivične infekcije često nastaju zbog jednostavne neravnoteže mikroorganizama prisutnih u tijelu.

Zapravo ga naseljava mnoštvo različitih gljivica i bakterija, većinom bezopasnih, pa čak i bitnih za pravilno funkcioniranje tijela.

Međutim, može se dogoditi da se neke od ovih gljiva razmnože i postanu patogene, ili da "vanjska" gljiva, koju prenosi, na primjer, životinja, izazove infekciju. Ukupno 200-400 vrsta gljiva može uzrokovati bolest kod ljudi⁵.

Međutim, gljive prisutne u okolišu mogu zaraziti i ljude, na primjer:

• inokulacijom, na primjer tijekom ozljede (koja dovodi do sporotrihoze ili kromomikoze, itd.);
• udisanjem plijesni (histoplazmoza, apergiloza itd.);
• u kontaktu sa zaraženom osobom (kandidijaza, lišajevi itd.);
• kontaktom sa zaraženom životinjom.