Simptomi se javljaju između 10 i 15 dana nakon ujeda zaraženog insekta. Određene vrste parazita malarije (Plasmodium vivax et Plasmodium ovale) može ostati neaktivan u jetri sedmicama ili čak mjesecima prije pojave prvih znakova.

Malariju karakteriziraju ponavljajući napadi koji se sastoje od tri faze:

• Zimica;
• Glavobolje;
• Umor i bol u mišićima;
• Mučnina i povraćanje;
• Dijareja (povremeno).

Sat ili dva sata kasnije:

• Visoka temperatura;
• Koža postaje vruća i suva.

Tada tjelesna temperatura pada:

• Obilno znojenje;
• Umor i slabost;
• Pogođena osoba zaspi.

Infekcije malarije P. vivax i P. ovale mogu se ponoviti nekoliko sedmica ili čak mjeseci nakon prve infekcije čak i ako je pacijent napustio područje infekcije. Ove nove epizode nastaju zbog "uspavanih" jetrenih oblika.